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第三，洁净手术部送回风系统所采用的形式，是至关重要的，也是接近手术部成功与否的关键所在。较大的综合性医院因所涉及的科室较多，在手术室进行的手术种类也比较多，为了避免因进行不同手术而有可能引起的交叉感染，每间手术室宜采用单独的空气净化系统，级别较低的接近手术室如果进行的是同一类手术，可以采用同一个洁净空调系统。百级、千级、万级洁净手术室应采用局部集中送风方式，也就是局部层流的送风方式。为了保证流经手术切口处的空气不被污染，集中布置的送风面积应和手术室等级相适应。
第四，手术室的空调送风系统的过滤器的选择，一般高级别的手术室(百级、千级、万级手术室)送回风采用三级过滤系统，回风经初效过滤风机加压，经过中效过滤，最后经末级高效过滤后送风。新风采用初、中效两级过滤。虽然有关规范允许较低级别的洁净手术室的末级过滤可采用高中效，但为了能保证洁净度以及长远打算，一般末级过滤也采用高效，这种做法在国内也默认。
第五，洁净手术部的施工是整个工程建设不可分割的一部分。选择一家有良好信誉及丰富施工经验的单位也是非常重要的。因为洁净手术是一项综合性工程，包括水、电、供气、自动控制等专业较多，需要多工种之间的配合，这要求洁净手术部的施工项目部要有较强的责任心与丰富的经验。
第六，在洁净手术部建成后的使用管理也是非常重要的。因为洁净手术部的兴起也是近几年内，所以，有的医院虽然建成了洁净手术部但并未得到很好的效果，主要原因还是在医护人员的观念和管理跟不上。因此广大医护人员应转变思想观念，充分认识建设洁净手术室的最终目的是降低感染率。此外，要制定相应的洁净手术部管理制度。
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